目前龜山島附近發現鯨豚共有十幾種。 事實上南北兩段的優勢種組成有異。 如：瑞氏海豚是南部海域的最常見種，飛旋海豚其次，然在龜山島附近瑞氏海豚卻是稀有紀錄，相對之下，穩定常見的飛旋原海豚卻成了北部常見的海豚，難怪大多數人到龜山島賞鯨常看到的就是飛旋海豚了。當你在茫茫海上搜尋時，飛旋原海豚會展示絕活，騰空前後翻滾數圈後，才俐落下水，牠們這番舉動莫不擾得遊客興奮異常，驚嘆四起。除了春夏常見的飛旋海豚之外，尚有七種鯨豚會於龜山島附近出沒，牠們分別是長吻真海豚、小虎鯨、瓶鼻海豚、侏儒抹香鯨、偽虎鯨 、熱帶斑海豚及瑞氏海豚等。其中長吻真海豚最特別，目前在東海岸僅發現於宜蘭縣海域，牠們是春天到初夏的訪客，5月份最容易看到牠們。偽虎鯨則是仲夏之客，以7-8月較易見到。

龜山島海域最常見的海豚有：
瓶鼻海豚、短吻飛旋海豚、長吻飛旋海豚、真海豚、瑞氏海豚、熱帶斑海豚、弗氏海豚。

龜山島海域最常見的鯨魚有：
偽虎鯨 、小虎鯨、虎鯨、小抹香鯨、抹香鯨、領航鯨。